Drug-resistant tuberculosis in Colombia, 2013-2018: Case-control study

Abtract Introduction. Multidrug-resistant/rifampicin-resistant tuberculosis (MDR/RR-TB) is difficult to control, has high morbidity and mortality, and demands priority public health intervention. In Colombia, MDR/RR-TB has been becoming more widespread annually. Before the COVID-19 pandemic, over an 8-year period, the number of cases of multidrug-resistant tuberculosis in Colombia was close to a thousand cases. Timely identification of the different risk factors for MDR/RR-TB will contribute fundamentally to the systematic management. Objective. To determine which risk factors were associated with the presentation of MDR in Colombia between 2013 and 2018. Materials and methods. A retrospective case-control study was carried out, for which the data from the routine surveillance of MDR/events in the country were used. Results. The cases of multidrug-resistant tuberculosis were mainly in young people, Afrodescendants, and males. Of the clinical conditions, comorbidities such as malnutrition, diabetes, and HIV, presence of at least one factor, such as drug dependence, taking immunosuppressive medications, belonging to the black race, afro, and living in an area of high disease burden were risk factors. Conclusion. In addition to the diagnosis and timely provision of MDR-TB treatment, it is necessary that public health programs at the local level pay special attention to patients with the identified risk factors.

Introducción. La tuberculosis multirresistente-resistente a la rifampicina (TB-MDR/RR) es difícil de controlar, tiene una alta morbilidad y mortalidad y exige una intervención prioritaria en salud pública. En Colombia, la TB-MDR/RR se ha ido extendiendo cada año. Antes de la pandemia de COVID-19, en un periodo de 8 años, el número de casos de TB-MDR/RR en Colombia se acercaba a los mil. La identificación oportuna de los diferentes factores de riesgo de TB-MDR/RR contribuirá de manera fundamental al manejo sistemático de la enfermedad. Objetivo. Determinar los factores de riesgo que se asociaron a la presentación de la TB- MDR/RR en Colombia entre 2013 y 2018. Materiales y métodos. Se realizó un estudio retrospectivo de casos y controles, para el cual se utilizaron los datos de la vigilancia rutinaria de eventos de TB MDR/RR en el país. Resultados. Los casos de TB MDR se presentaron principalmente en jóvenes, afrodescendientes y varones. De las condiciones clínicas, fueron factores de riesgo las comorbilidades como la desnutrición, la diabetes y el VIH, y la presencia de, al menos, un factor como la farmacodependencia, el consumo de medicamentos inmunosupresores, el ser de raza negra o afro y el vivir en una zona del país de alta carga de tuberculosis. Conclusiones. Además del diagnóstico y la provisión oportuna del tratamiento de la TB MDR, es necesario que los programas de salud pública a nivel local presten especial atención a los pacientes con los factores de riesgo identificados.

Red Nacional de Gestión de Conocimiento, Investigación e Innovación en Tuberculosis en Colombia / National Network for Knowledge Management, Research, and Innovation in Tuberculosis in Colombia / Rede Nacional de Gestão do Conhecimento, Pesquisa e Inovação em tuberculose na Colômbia

RESUMEN El Ministerio de Salud y Protección Social de Colombia, en colaboración con el Instituto Nacional de Salud y la Organización Panamericana de la Salud, convocaron en 2018 a todos los actores asociados al Programa Nacional de Prevención y Control de la Tuberculosis (PNPCT) y el Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación a la conformación de una red nacional que coordinara la investigación operativa (IO) relacionada con la tuberculosis (TB) en el país. Se realizaron siete talleres en los que se llegó al consenso de establecer la Red Nacional de Gestión de Conocimiento, Investigación e Innovación en Tuberculosis en Colombia (Red TB Colombia). Con más de 180 participantes, organizados en un nodo central y cinco nodos regionales que agrupan a las 37 entidades territoriales, en 2019 la Red TB Colombia realizó cuatro jornadas de capacitación en IO y definió 65 temas priorizados de investigación, ajustados a las líneas estratégicas establecidas por el PNPCT: prevención y atención integral, con foco en los afectados por la TB (41 temas en tres módulos) y compromiso político, protección social y sistemas de apoyo (24 temas en cuatro módulos). La priorización se realizó por el método de comparación por pares. La Red TB Colombia sigue activa y contribuye a la gestión del conocimiento dirigido a eliminar la TB en el país y ha permitido avanzar en la construcción de planes y la ejecución de proyectos locales de IO que generan resultados científicamente validados para fortalecer el PNPCT y mejorar la atención de los pacientes con TB.

ABSTRACT In 2018, the Colombian Ministry of Health and Social Protection, in collaboration with the National Health Institute and the Pan American Health Organization, convened all actors associated with the National Tuberculosis Prevention and Control Program (PNPCT) and the National Science, Technology, and Innovation System to form a national network to coordinate operations research on tuberculosis (TB) in the country. Seven workshops were held and a consensus was reached to establish the National Network for Knowledge Management, Research, and Innovation in Tuberculosis in Colombia (TB Colombia Network). With more than 180 participants, a central node, and five regional nodes that bring together the country's 37 territorial entities, the TB Colombia Network conducted four days of training in operations research in 2019, defining 65 priority research topics aligned with the strategic lines in the PNPCT: prevention and comprehensive care, with a focus on people affected by TB (41 topics in three modules); and political commitment, social protection, and support systems (24 topics in four modules). The peer comparison method was used for prioritization. The TB Colombia Network remains active and contributes to knowledge management aimed at eliminating TB in Colombia. It has helped make progress in building plans and implementing local operations research projects that generate scientifically validated results to strengthen the PNPCT and improve the care of TB patients.

RESUMO O Ministério da Saúde e Previdência Social da Colômbia, em cooperação com o Instituto Nacional de Saúde e a Organização Pan-Americana da Saúde (OPAS), convocou em 2018 todas as partes interessadas vinculadas ao Programa Nacional de Prevenção e Controle da Tuberculose (PNPCT) e ao Sistema Nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação para formar uma rede nacional com o objetivo de coordenar a pesquisa operacional em tuberculose no país. Foram promovidos sete seminários e, deste processo, se chegou a um consenso para criar a Rede Nacional de Gestão do Conhecimento, Pesquisa e Inovação em Tuberculose na Colômbia (Rede TB Colômbia). A rede conta com mais de 180 participantes, organizados em um núcleo central e cinco núcleos regionais que congregam 37 entidades territoriais. Em 2019, a Rede TB Colômbia realizou quatro jornadas de capacitação em pesquisa operacional e definiu 65 áreas temáticas prioritárias de pesquisa harmonizadas com as linhas estratégicas estabelecidas pelo PNPCT: prevenção e atenção integral com enfoque nas pessoas com TB (41 áreas temáticas divididas em três módulos) e compromisso político, proteção social e sistemas de apoio (24 áreas temáticas divididas em quatro módulos). A priorização foi definida pelo método de comparação pareada. A Rede TB Colômbia continua ativa contribuindo para a gestão do conhecimento voltado à eliminação da tuberculose no país e possibilitando avançar na formulação de planos e execução de projetos locais de pesquisa operacional com a produção de resultados científicos validados para fortalecer o PNPCT e melhorar a atenção das pessoas com TB.

SARS-CoV-2 y RT-PCR en pacientes asintomáticos: resultados de una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado de Bogotá, 2020 / SARS-CoV-2 and RT-PCR in asymptomatic patients: Results of a cohort of workers at El Dorado International Airport in Bogotá, 2020

Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORFlab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.

Introduction: The 2019 coronavirus pandemic (COVID-19) has caused around 25 million cases worldwide. Asymptomatic patients have been described as potential sources of transmission. However, there are difficulties to detect them and to establish their role in the dynamics of virus transmission, which hinders the implementation of prevention strategies. Objective: To describe the behavior of asymptomatic SARS-CoV-2 virus infection in a cohort of workers at the El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" International Airport in Bogotá, Colombia. Materials and methods: A prospective cohort of 212 workers from the El Dorado airport was designed. The follow-up began in June, 2020. A survey was used to characterize health and work conditions. Every 21 day, a nasopharyngeal swab was taken to identify the presence of SARS-CoV-2 using RT-PCR. We analyzed the behavior of the cycle threshold (ORFlab and N genes) according to the day of follow-up. Results: In the first three follow-ups of the cohort, we found an incidence of SARS-CoV-2 infection of 16.51%. The proportion of positive contacts was 14.08%. The median threshold for cycle threshold was 33.53. Conclusion: We characterized the asymptomatic SARS-CoV-2 infection in a cohort of workers. The identification of asymptomatic infected persons continues to be a challenge for epidemiological surveillance systems.

Perspectiva histórica del origen evolutivo de la resistencia a antibióticos / Evolutionary origin of antibiotic resistance, a historical perspective

Resumen La resistencia a antimicrobianos representa un aspecto natural de evolución bacteriana, que puede resultar de mutaciones o por adquisición de genes foráneos. Hay diferentes posturas sobre el origen de ésta resistencia que explican la habilidad de estos microorganismos de adquirir nuevas características. Las teorías de la evolución de Lamarck y Darwin, han dado pie a experimentos diseñados para explorar el origen de la variación bacteriana y surgimiento de nuevas características. Estos estudios muestran que la resistencia está relacionada con mutaciones en genes cromosomales y/o la transferencia de elementos genéticos extracromosomales, que se expresan según la presión antibiótica ejercida. Está revisión recopila los principales experimentos y las conclusiones derivadas para explicar el fenómeno de resistencia a antibióticos.

Abstract Antimicrobial resistance is a natural aspect of bacterial evolution that can result from mutations or acquisition of foreign genes. Various views on the origin of this resistance explain the ability of these organisms to acquire new features. Lamarck and Darwin's theories of evolution have led to experiments designed to explore the origin of bacterial variation and the emergence of new features. These experiments show that antimicrobial resistance is related to mutations in chromosomal genes and/or transfer of extrachromosomal genetic elements that can be expressed based on the antibiotic pressure exerted. The main experiments and findings that seek to explain the phenomenon of antibiotic resistance are reviewed here in.